LITL 可借鉴资料库

为 lab-in-the-loop 项目整理的 91 条可直接借鉴的代码、论文、教程、BP 对标和硬件,链接均已逐条检查。

先看这 10 个

1. VERID 博客(四个能力 + 3 个案例)Google Research2. SBL 论文 §2.4:协议冻结与上机流水线arXiv3. AC Microcourses hello-world 配色闭环课Acceleration Consortium4. PyLabRobot(空跑后端 + OT-2 后端)GitHub5. Opentrons Python API 教程 + 模拟器Opentrons6. OT-2 APIv2 新手练习GitHub7. self-driving-lab-demo + 10 分钟视频GitHub8. PCCB_OpenTrons:OT-2 + 相机配色闭环GitHub9. jubilee_pipette_BOdemo:移液 + 贝叶斯优化GitHub10. BayBE(Mixtures 示例)GitHub

第 1 条有中文全译:https://www.spke.com/zh/ai/article/3533 。第 7 条配套视频:https://www.youtube.com/watch?v=D54yfxRSY6s 。第 10 条也可换成 Honegumi:https://github.com/sgbaird/honegumi 。

全部条目

路径:①CRO ②License-out ③自研管线 ④设备与平台;POC 步骤 P0–P6。标 403 的链接是网站拦截爬虫,浏览器可打开。

类别名称能直接拿什么对应路径/POC步优先级
代码PyLabRobot/pylabrobot先读:pylabrobot/liquid_handling/backends/chatterbox.py(空跑后端)、`liquid_handling/backends/o…④ 全路径底座;P0、P1、P3高
代码PyLabRobot 文档站照着 hello-world 把 chatterbox 换成 OpenTrons backend;支持设备清单见 Supported Machines(选读板器前先查这里)P3、P4高
代码PyLabRobot Byonoy A96A 读板器页把“虚拟 plate reader”换成真读板器时的接口样板(虚拟→真实只换 backend)P4高
代码PyLabRobot/slas_2026_demos看多设备编排怎么写;demo 布展参考④;P5 之后中
代码Opentrons/opentrons先读:api/src/opentrons/simulate.py(opentrons_simulate 命令=SBL 用的“与机器软件版本一致的模拟器”)、`api/s…P0、P3(SBL 流程:模拟→SHA-256→上机)高
代码Opentrons Python API 教程最小 OT-2 协议模板(metadata/requirements/apiLevel)直接拿来做颜料协议骨架P3高
代码Opentrons Protocol Library找“染料/稀释/归一化”类协议当模板;看别人如何写参数化协议①CRO 的服务菜单参考;P3中
代码Opentrons/Protocols批量 grep 参考写法;不建议直接复制进产品P3低
代码sparks-baird/self-driving-lab-demo先读:notebooks/2.2-sensor-simulator.ipynb(虚拟传感器=我们的虚拟读板器)、`3.1-random-vs-grid-vs-bayesia…P1、P4;BP 技术章“随机 vs BO”图高
代码pozzo-research-group/jubilee_pipette_BOdemo先读:src/*/color_matcher.py(编排类)、in_silico_mixing.py(仿真混色模型,可替换我们仿真的混色函数)P4;④高
代码Jonpot/PCCB_OpenTrons先读:color_matching/main_active_learning.py、color_matching/robot/ot2_utils.pyP3、P4;最接近“真 OT-2 + 便宜相机”的现成代码高
代码OptoBot(GitHub)先读:docs/basic_example.rst、examples/、optobot/P4中
代码pudap/bears-skills抄思路:上机前相机核对台面=P0 的真机版;RMSE 打分;BO 或 LLM 二选一建议P0、P2低
代码the-matter-lab/olympus用它的“优化器对比”跑法给 BP 出 benchmark 图P4、P5中
代码SDL demo 演示视频(YouTube)与教程区同一视频P4中
代码facebook/AxService API 的 get_next_trial / complete_trial 两行就是闭环接口P4高
代码emdgroup/baybe先读:examples/Basics/campaign.py、examples/Mixtures/(体积比和=1,正好是配色问题)、examples/Backtesting/P4;②/③ 数据驱动发现的叙事高
代码sgbaird/honegumi在网页勾选“组成约束+批量”直接拿代码;notebooks/ 有教程P4高
代码meta-pytorch/botorch只在需要自定义采集函数时看P4低
代码bayesian-optimization/BayesianOptimization给新手先理解 BO 用;仿真里可做最小依赖版本P4中
代码the-matter-lab/atlas看它的“已知约束/未知约束(实验失败)”处理=失败的实验也要喂给优化器P2、P4中
代码sustainable-processes/summit多目标(颜色误差+用量/时间)写法参考P4低
代码CederGroupHub/alabos抄:任务状态机、设备锁、失败重试的数据库设计P1、P2;④中
代码AD-SDL/MADSci看节点/工作流/事件日志的分层,作 BP“平台架构图”参考④;P1中
代码AD-SDL/weiYAML 描述工作站+工作流的写法P3低
代码dgretton/pyhamilton仅作“同类 SDK”对照;含错误恢复示例④低
代码Bioprotocols/labop“协议即数据”:协议可哈希、可比对,支撑 P3 与①CRO 的可追溯P3低
代码autoprotocol/autoprotocol-python看云实验室怎样把协议做成 JSON 订单(①CRO 远程下单形态)①低
代码SiLA2/sila_python④ 产品化时“支持 SiLA”是对接大药企的话术;POC 阶段不需要④低
代码ur-whitelab/chemcrow-public抄“工具调用+安全检查”结构给 P2 的 LLM 归因P2低
论文方法Google Research 博客:Grounding AI agents in biological reality照抄 “Grounding agents in physical reality” 一节的四项能力作为 POC 验收清单:实时 3D 状态追踪、秒级虚拟预演等P0、P1、P2、P4;④ BP 技术章高
论文方法Eigen Radar:Finding a pipette error by reversing the experiment归因方法直接抄:怀疑某个硬件时先“交换角色”再重复,而不是原样重复;写进归因器作为一条规则P2高
论文方法Vastkind:Google's VERID Lab Digital Twin抄“先拷贝当前状态→在副本上跑整段命令→派发前再对实时状态复核一次”的两段式检查;72 vs 71.2 mm 可做 demo 拦截用例P0高
论文方法科技日报:AI智能体自主完成湿实验室闭环测试中文 BP 里引用对标时直接用这些措辞;建议先读中译BP中
论文方法SBL 论文 arXiv 2610.23826 §2.4 + 图 5逐步照抄上机流水线:只读 API 查台面→离线写协议→同版本模拟器跑→SHA-256 冻结→网关拒绝哈希不符的协议P3(协议哈希)、P1高
论文方法SBL 论文:Equipment / Software 两节抄:每台仪器做成 HTTP 服务,提供只读 GET /status 和 OpenAPI 文档;中央 API 发 claim token(设备锁)并记录P1、P3;④高
论文方法SBL 论文:§2.3 技能沉淀 + Safety Guardrail抄分层:规则/脚本优先,LLM 只处理例外,对应 P2“规则+轻量 LLM 归因”;安全护栏三层P2高
论文方法SBL 论文:表 1、表 2表 1 的三列对比格式借来做 BP 的“我们处在哪”页;表 2 说明从仿真起步到有一台 OT-2 的路线BP高
论文方法SBL 论文:第 3 节 Discussion抄“API 不报错的静默失败”作为故障库里单独一类(靠读数或相机发现);BP“能力边界”页照此写P2;BP中
论文方法Automation isn't Automatic(Chem. Sci. 2021)用作故障分类的“来源清单”,也可用于 BP 里“为什么需要可信闭环”的论据P2;BP中
论文方法Steering towards safe self-driving laboratories(Nat Rev Chem 2025)抄安全分层框架,放进 BP 的风控页P0、P2中
论文方法Self-driving laboratories need an autonomy safety harness(Nat Synth 2026)BP 叙事:我们卖的是“可信护栏”,不是规模BP、④中
论文方法Stress-testing LLM agents in a robotic chemistry laboratory(arXiv 2607.23045)抄它的失败类型统计方式来做我们的故障注入表P2中
论文方法Opentrons Flex Error Recovery 说明直接作为“纠正动作”的枚举:自动纠正至少覆盖这几种,并说明 OT-2 原生没有、我们补上P2;④高
论文方法PyLabRobot 论文(Device 2023)引用它说明底座经过同行评审;抄论文里的架构图画法P0;BP中
论文方法CLSLab:Light(Star Protocols 2023)抄“随机 / 网格 / BO 对比”这个闭环指标:达到目标误差所需的实验轮数P4;BP 图高
论文方法Self-driving lab demo 白皮书(Matter 2022)BP 中“先用便宜 demo 证明闭环”这条路线的学术依据BP中
论文方法How to build an effective self-driving laboratory(MRS Bull 2023)新手可当清单逐条对照全流程中
论文方法Coscientist(Nature 2023)抄它“文档检索→写代码→OT-2 执行”的流程图;代码见 chemcrow 一条P2;BP 对标中
论文方法ChemOS 2.0(Matter 2024)按需查:编排架构(ChemOS 2.0)、数字孪生(MATTERIX)、低成本路线P3、P5低
教程AC Microcourses:Introduction to AI for Discovery using SDLs按 1.1→1.5 的顺序学,最适合新手的闭环入门;仓库 AccelerationConsortium/ac-microcourses(MIT)P4、P1高
教程AC Microcourses:robotics 课机器人模块:液体处理工作站与计算机视觉两节最相关P3、P4高
教程U of T 继续教育 4010 课程页只看学习目标列表,可以当团队的能力清单—低
教程1.1 Run the Demo不买硬件也能先跑 Colab 里的 test 模式P4中
教程Learn self-driving labs with a simple demo(YouTube 10:33)10 分钟看懂“闭环”是什么;简介里给了 Colab 一键试跑链接P4高
教程PyLabRobot YouTube 频道新增自定义板/槽定义时照着视频做P0、P3中
教程Going Cross-Platform with PyLabRobot & UniteLabs(YouTube)产品形态参考:④ 平台化 demo 应该长这样;BP 里可作对标截图④中
教程tyhho/OT-2_APIv2_Workshop先读 Elementary Python for OT-2 API.ipynb,再读 beginner 教程和 simulate.pyP3;新手入门高
教程Opentrons Python API 教程与代码区同一条;放在这里是为了学习顺序P3高
教程science-jubilee 配色 demo 搭建指南材料清单(红黄蓝白黑丙烯颜料、96 孔板等)直接照抄成耗材单P4高
教程哲见 WISE AI:VERID 博客全文中译先读这篇再读英文原文P0–P2高
教程环球网科技:AI智能体自主完成湿实验室闭环测试BP 里“行业热度”可以引用BP低
BP竞品Transfyr $25M 种子轮公告定位和我们的同步日志、故障归因几乎一样,可参考它的一句话定位和问题陈述写法②④,P1–P2高
BP竞品Medra 融资 $52M 并与 Genentech 合作参考“先拿下一家药企合作,再讲规模化”的 BP 结构①③高
BP竞品Medra 官网对照它的首页文案写我们的 CRO 版本 landing page①中
BP竞品Periodic Labs 以 $300M 启动用来说明赛道热度(BP 的“为什么是现在”一页)③中
BP竞品Trilobio $8M 种子轮种子轮规模最接近,参考它的里程碑写法和硬件 + 软件叙事④高
BP竞品Ginkgo Datapoints:What we doP5/P6“数据资产”的商业化范例,参考它的服务分层②,P5–P6高
BP竞品Ginkgo 2026 Q1 财报幻灯片(PDF)BP 引用:大公司已在用 lab-in-the-loop 叙事;也能参考收入拆分②,P5中
BP竞品LILA:Inside LILA's RNA discovery engine参考闭环示意图怎么画(模型 → 实验 → 数据 → 模型)③,P4中
BP竞品Warp Sciences $215M A 轮公告(2026-10-22)最新同路对标:“AI+机器人的美国化学 CRO,不做自有管线,先人工交付再逐步自动化”,可参考它的叙事和分阶段自动化路线;Lightspeed 投资备忘录 https://lsvp.com/stories/why-were-backing-warp/①④;BP高
BP竞品Emerald Cloud LabCRO 路径最直接的对标:按实验收费、远程下单①中
BP竞品UniteLabs对照我们 ④ 路径的卖点:让设备都能用 Python 控制④,P3高
BP竞品Automata参考它的“集成商”定位和客户案例页写法④低
BP竞品Biosero调度层的成熟竞品,BP 竞品表里要放④低
硬件Opentrons 中国:移液工作站价格做预算的第一手价格①④,P3高
硬件Opentrons 深圳子公司介绍国内购买和售后渠道;子公司为“合创生物”这一说法未核实P3高
硬件OT-2 中国产品页核对台面槽位和移液器型号,用来配 PyLabRobot 台面定义P0、P3高
硬件OT-2 美国产品页(403,浏览器可开)$15,950 起,和国内价做对比P3中
硬件Flex 美国产品页(403,浏览器可开)$24,950 起;OT-2 缺货时的备选P3中
硬件Nayo A8 mini国产备选;有 REST API 线索,未核实,PyLabRobot 不支持④低
硬件LabX 二手 Opentrons(403)二手 OT-2 标价 $2,500–5,750,只作参照—低
硬件Byonoy Absorbance 96 Automate€8,750,PyLabRobot 已支持;P4 读数闭环最省事的选择P4高
硬件Byonoy Absorbance 96(手动版)€3,990,PyLabRobot 不支持;便宜但打不通自动闭环,别买错型号P4中
硬件BioTek Epoch 2(翻新)翻新 $5,745–7,388,PLR 不支持;买 BioTek 要选 PLR 支持的型号P4低
硬件Raspberry Pi Camera Module 3(Adafruit 5657)给 OT-2 装俯拍相机,用颜色读数做最便宜的闭环(参考 PCCB_OpenTrons、AC 课程 3.5)P1、P4高
硬件仪器信息网 移液工作站类目(403)国产酶标仪 ¥1–6 万,但能否 Python 控制都不确定④低
硬件Jubilee开源工具更换平台,可自制移液平台,配 jubilee_pipette_BOdemo④低
硬件OpenFlexure开源 3D 打印显微镜,低成本成像读数P4低
硬件openUC2/UC2-GIT模块化开源光学套件,自制读数装置P4低
硬件uFactory Lite 6低价 6 轴机械臂,以后搬板子用;POC 阶段不需要④低

对决策有用

  1. OT-2 国内能从官方渠道买:中国官网参考价 OT-2 整机 ¥93,000、Flex ¥174,000,移液器 ¥2.3–3.3 万/支(标价,未询价)。来源:https://opentrons.com.cn/news/yiygongzuozhanjiageguima/
  2. Opentrons 在深圳的子公司是“合创生物”——此说法未核实,询价前需确认主体。
  3. 读板仪选 Byonoy Absorbance 96 Automate(€8,750,PyLabRobot 已支持);€3,990 的手动版不支持,接不进自动闭环。
  4. 最便宜的闭环:OT-2 加树莓派相机做颜色读数,PCCB_OpenTrons 和 AC 课程已有现成做法。
  5. BP 叙事最接近的对标是 Transfyr(“科学的可观测性层”)和 Trilobio($8M 种子轮),数字来自公司公告,未交叉核实。

缺口

  1. VERID、SBL、ChemOS 2.0 都没有公开代码,只能照论文和博客复现。
  2. B 站上的 OT-2 教学视频没找到可核实的具体链接,未收录。
  3. 除 VERID 和 SBL 外,多数论文只读了摘要。
  4. 价格全是网页标价:含税、交期、整机是否含移液器都不确定。
  5. 国产酶标仪和移液工作站能否用 Python 控制,公开资料查不到。
  6. 没找到竞品的完整 BP 原文,只能参考融资公告和官网文案。